L’histoire se déroule dans un monde où des individus immortels appelés “Ajin” existent. Lorsqu’un Ajin meurt, il revient à la vie, ce qui les rend précieux pour la recherche scientifique et les gouvernements.
Kei Nagai, un étudiant, découvre qu’il est lui-même un Ajin après un accident mortel. Traqué par les autorités, il s’associe avec d’autres Ajin pour échapper à la capture. Le gouvernement tente d’utiliser les Ajin comme cobayes, provoquant des conflits violents entre les Ajin et les forces de l’ordre.