L’histoire se déroule après les événements de la série principale, Eikichi Onizuka, se trouve dans une situation délicate. Il est accusé à tort d’enlèvement et doit se cacher pour échapper à la police. Plutôt que de fuir, Onizuka décide de rester à Shonan, où il a enseigné auparavant, pendant 14 jours afin de prouver son innocence. Pendant cette période, Onizuka se retrouve à devoir gérer diverses situations compliquées et à faire face à de nouveaux défis.